《杭州师范学院学报》（自然科学版）创刊于1979年8月。1989年并入《杭州师范学院学报》（综合版），每年正常出刊，直到2002年6月借《杭州教育学院学报》更名的机会，正式成为独立的自然科学类双月刊学报。该刊主要刊登校内外学者在数学、物理学、信息工程、化学、生物学、地理学、体育学以及技术科学、交叉科学等基础研究与应用研究方面的学术论文。努力反映最新学术科研成果，促进学术交流。《杭州师范大学学报》（社会科学版）多年来以创高水平学术期刊为目标，关注中国社会变革、理论前沿与学术自身增长，实事求是，繁荣学术，积累文化，服务于科研教学。本刊学术优势在文化、哲学、历史、学术史、语言学、传播学、社会学、经济学等学科。获奖情况：中文核心期刊(2011)、中文核心期刊(2008)、中国人文社会科学核心期刊要览(2008年版)、北大2008版核心期刊。
设有学术论文、学术综述、教学研究等栏目。
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